MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 35003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	AT	3	6	5113	5118	50 %	50 %	0 %	0 %	340623185
2	NC_015847	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	340623185
3	NC_015847	TGA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623185
4	NC_015847	AT	3	6	5195	5200	50 %	50 %	0 %	0 %	340623185
5	NC_015847	CTT	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623185
6	NC_015847	TTG	2	6	5223	5228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623185
7	NC_015847	AGA	2	6	5231	5236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
8	NC_015847	A	8	8	5244	5251	100 %	0 %	0 %	0 %	340623185
9	NC_015847	GAA	3	9	5258	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
10	NC_015847	CGGATG	2	12	5317	5328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340623185
11	NC_015847	ATA	2	6	5420	5425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
12	NC_015847	A	8	8	5428	5435	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
13	NC_015847	GAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
14	NC_015847	GAA	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
15	NC_015847	AAT	2	6	5561	5566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
16	NC_015847	CTT	2	6	5628	5633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
17	NC_015847	AAT	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
18	NC_015847	TGGAA	2	10	5743	5752	40 %	20 %	40 %	0 %	340623186
19	NC_015847	AGA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
20	NC_015847	TC	3	6	5782	5787	0 %	50 %	0 %	50 %	340623186
21	NC_015847	TGA	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
22	NC_015847	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
23	NC_015847	TGCA	2	8	5860	5867	25 %	25 %	25 %	25 %	340623186
24	NC_015847	ATA	2	6	5870	5875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
25	NC_015847	T	6	6	5906	5911	0 %	100 %	0 %	0 %	340623186
26	NC_015847	GAT	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
27	NC_015847	CTT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
28	NC_015847	AT	3	6	6062	6067	50 %	50 %	0 %	0 %	340623186
29	NC_015847	AAT	2	6	6106	6111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
30	NC_015847	AAT	2	6	6149	6154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
31	NC_015847	A	6	6	6210	6215	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
32	NC_015847	A	7	7	6224	6230	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
33	NC_015847	TAA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
34	NC_015847	A	6	6	6250	6255	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
35	NC_015847	TCA	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623186
36	NC_015847	GAA	2	6	6263	6268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
37	NC_015847	AATT	2	8	6270	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	340623186
38	NC_015847	TGA	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
39	NC_015847	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
40	NC_015847	ATA	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
41	NC_015847	T	6	6	6472	6477	0 %	100 %	0 %	0 %	340623187
42	NC_015847	AATT	2	8	6479	6486	50 %	50 %	0 %	0 %	340623187
43	NC_015847	CCA	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623187
44	NC_015847	ACT	2	6	6537	6542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
45	NC_015847	TGGAAA	2	12	6641	6652	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340623187
46	NC_015847	AT	3	6	6669	6674	50 %	50 %	0 %	0 %	340623187
47	NC_015847	GT	3	6	6711	6716	0 %	50 %	50 %	0 %	340623187
48	NC_015847	ATC	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
49	NC_015847	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
50	NC_015847	GT	3	6	6845	6850	0 %	50 %	50 %	0 %	340623187
51	NC_015847	CTG	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
52	NC_015847	TGG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623187
53	NC_015847	TCT	2	6	6969	6974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
54	NC_015847	ACT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
55	NC_015847	TC	3	6	7023	7028	0 %	50 %	0 %	50 %	340623187
56	NC_015847	TCA	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
57	NC_015847	TGA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623187
58	NC_015847	CAT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
59	NC_015847	GCT	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
60	NC_015847	TTG	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623187
61	NC_015847	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623187
62	NC_015847	TCC	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623187
63	NC_015847	TA	3	6	7632	7637	50 %	50 %	0 %	0 %	340623188
64	NC_015847	TAGA	2	8	7705	7712	50 %	25 %	25 %	0 %	340623188
65	NC_015847	TTC	2	6	7714	7719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
66	NC_015847	CTT	2	6	7731	7736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
67	NC_015847	T	6	6	7762	7767	0 %	100 %	0 %	0 %	340623188
68	NC_015847	AAT	2	6	7795	7800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623188
69	NC_015847	AATC	2	8	7818	7825	50 %	25 %	0 %	25 %	340623188
70	NC_015847	AT	3	6	7827	7832	50 %	50 %	0 %	0 %	340623188
71	NC_015847	AAT	2	6	7855	7860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623188
72	NC_015847	T	7	7	7875	7881	0 %	100 %	0 %	0 %	340623188
73	NC_015847	CCA	2	6	7887	7892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623188
74	NC_015847	TTC	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
75	NC_015847	ATTT	2	8	7924	7931	25 %	75 %	0 %	0 %	340623188
76	NC_015847	AAG	2	6	7933	7938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623188
77	NC_015847	TTC	2	6	7954	7959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
78	NC_015847	ATT	3	9	7976	7984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623188
79	NC_015847	CTGTT	2	10	7991	8000	0 %	60 %	20 %	20 %	340623188
80	NC_015847	TGG	2	6	8159	8164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623188
81	NC_015847	CTT	2	6	8217	8222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623188
82	NC_015847	CCA	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623188
83	NC_015847	AATT	2	8	8254	8261	50 %	50 %	0 %	0 %	340623188
84	NC_015847	T	6	6	8264	8269	0 %	100 %	0 %	0 %	340623188
85	NC_015847	TTG	2	6	8333	8338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623188
86	NC_015847	ATT	2	6	8456	8461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623188
87	NC_015847	CAA	2	6	8464	8469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623188
88	NC_015847	ATT	2	6	8575	8580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
89	NC_015847	T	6	6	8595	8600	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
90	NC_015847	AGT	2	6	8603	8608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623189
91	NC_015847	ATTTT	2	10	8631	8640	20 %	80 %	0 %	0 %	340623189
92	NC_015847	T	6	6	8637	8642	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
93	NC_015847	CAA	2	6	8661	8666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
94	NC_015847	T	6	6	8751	8756	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
95	NC_015847	T	6	6	8763	8768	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
96	NC_015847	ATT	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
97	NC_015847	AT	3	6	8794	8799	50 %	50 %	0 %	0 %	340623189
98	NC_015847	TTC	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623189
99	NC_015847	AATT	2	8	8857	8864	50 %	50 %	0 %	0 %	340623189
100	NC_015847	ATT	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
101	NC_015847	CAG	2	6	8994	8999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340623189
102	NC_015847	CAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623189
103	NC_015847	T	6	6	9108	9113	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
104	NC_015847	T	7	7	9243	9249	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
105	NC_015847	T	6	6	9309	9314	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
106	NC_015847	ATT	2	6	9323	9328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
107	NC_015847	A	6	6	9403	9408	100 %	0 %	0 %	0 %	340623189
108	NC_015847	T	6	6	9409	9414	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
109	NC_015847	T	7	7	9430	9436	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
110	NC_015847	AAT	2	6	9517	9522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
111	NC_015847	ATA	2	6	9523	9528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
112	NC_015847	GT	3	6	9540	9545	0 %	50 %	50 %	0 %	340623189
113	NC_015847	T	6	6	9545	9550	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
114	NC_015847	T	6	6	9605	9610	0 %	100 %	0 %	0 %	340623189
115	NC_015847	TTA	2	6	9633	9638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
116	NC_015847	TTC	2	6	9680	9685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623189
117	NC_015847	ATATG	2	10	9746	9755	40 %	40 %	20 %	0 %	340623189
118	NC_015847	AATA	2	8	9772	9779	75 %	25 %	0 %	0 %	340623189
119	NC_015847	TAT	2	6	9847	9852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623189
120	NC_015847	CTG	2	6	9904	9909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623189
121	NC_015847	CAA	2	6	9927	9932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
122	NC_015847	CAA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
123	NC_015847	CAA	2	6	9954	9959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623189
124	NC_015847	TCA	2	6	10007	10012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623189
125	NC_015847	AAAAT	2	10	10030	10039	80 %	20 %	0 %	0 %	340623189
126	NC_015847	AAT	2	6	10044	10049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623189
127	NC_015847	TGC	2	6	10069	10074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623189
128	NC_015847	A	6	6	10106	10111	100 %	0 %	0 %	0 %	340623189
129	NC_015847	CATAA	2	10	10117	10126	60 %	20 %	0 %	20 %	340623189
130	NC_015847	AT	3	6	10279	10284	50 %	50 %	0 %	0 %	340623190
131	NC_015847	TGGA	2	8	10291	10298	25 %	25 %	50 %	0 %	340623190
132	NC_015847	ACA	2	6	10304	10309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340623190
133	NC_015847	AG	3	6	10324	10329	50 %	0 %	50 %	0 %	340623190
134	NC_015847	GAA	2	6	10388	10393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623190
135	NC_015847	TAAT	2	8	10461	10468	50 %	50 %	0 %	0 %	340623190
136	NC_015847	TAA	2	6	10536	10541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623190
137	NC_015847	AGA	2	6	10549	10554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623190
138	NC_015847	GTT	2	6	10601	10606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623190
139	NC_015847	GAAG	2	8	10610	10617	50 %	0 %	50 %	0 %	340623190
140	NC_015847	ATT	2	6	10628	10633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623190
141	NC_015847	CAT	2	6	10645	10650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623190
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143	NC_015847	AATT	2	8	10797	10804	50 %	50 %	0 %	0 %	340623190
144	NC_015847	ATG	2	6	10904	10909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623190
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146	NC_015847	AAAAC	2	10	11052	11061	80 %	0 %	0 %	20 %	340623190
147	NC_015847	GA	3	6	11125	11130	50 %	0 %	50 %	0 %	340623190
148	NC_015847	TAT	2	6	11134	11139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623190
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153	NC_015847	CG	3	6	11320	11325	0 %	0 %	50 %	50 %	340623190
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162	NC_015847	AAT	2	6	11967	11972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623192
163	NC_015847	ATT	2	6	11973	11978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623192
164	NC_015847	AAG	2	6	12005	12010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623192
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167	NC_015847	A	6	6	12199	12204	100 %	0 %	0 %	0 %	340623192
168	NC_015847	GTG	2	6	12278	12283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623192
169	NC_015847	A	6	6	12322	12327	100 %	0 %	0 %	0 %	340623192
170	NC_015847	AATA	2	8	12336	12343	75 %	25 %	0 %	0 %	340623192
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175	NC_015847	A	6	6	12511	12516	100 %	0 %	0 %	0 %	340623192
176	NC_015847	TAAAA	5	25	12517	12541	80 %	20 %	0 %	0 %	340623192
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178	NC_015847	TGT	2	6	12583	12588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623193
179	NC_015847	AAT	2	6	12615	12620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623193
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